醫院污水處理設備利用活性污泥法達到凈化生活污水的目的。其原理：利用好氧菌自身的生命活動，在污水中，微生物形成的生物絮凝體使懸浮狀和膠體狀的有機污染物失穩絮凝，吸附在活性污泥表面，降解有機物，使水中的BOD、COD大幅下降。具有耐污能力強、動力消耗低、操作運行穩定、維護方便的特點，使得地埋式一體化生活污水處理設備有很廣的應用前景和推廣價值。
醫院污水處理設備的處理方法要根據污水水質、污水水量及出水水質標準等進行選擇。醫院污水處理設備廢水處理方法主要分為化學處理法、物理處理法、和生物處理法三類。
1、化學處理法通過化學反應和傳質作用來分離、去除廢水中呈溶解、膠體狀態的污染物或將其轉化為無害物質的廢水處理法。在化學處理法中，以投加藥劑產生化學反應為基礎的處理單元是：混凝、中和、氧化還原等；
2、物理處理法通過物理作用分離、回收廢水中不溶解的呈懸浮狀態的污染物（包括油膜和油珠）的廢水處理法，可分為重力分離法、離心分離法和篩濾截留法等。屬于重力分離法的處理單元有：沉淀、上浮（氣浮）等，相應使用的處理設備是沉砂池、沉淀池、隔油池、氣浮池及其附屬裝置等。
3、生物處理法通過微生物的代謝作用，使廢水中呈溶液、膠體以及微細懸浮狀態的有機污染物，轉化為穩定、無害的物質的廢水處理法。根據作用微生物的不同，生物處理法又可分為需氧生物處理和厭氧生物處理兩種類型。
